Trong những năm qua, công tác CCHC luôn được xã Trường Yên quan tâm. Hằng năm, ngay từ đầu năm, xã đã xây dựng kế hoạch CCHC, tiến hành rà soát và kịp thời ban hành quyết định bãi bỏ, thay thế các thủ tục hành chính thuộc phạm vi áp dụng tại xã theo tiêu chuẩn ISO 9001: 2008. Đến năm 2020 chuyển đổi áp dụng theo tiêu chuẩn ISO 9001: 2018. Hiện nay, số TTHC áp dụng tại xã là 137 thủ tục.

Để tạo điều kiện thuận lợi trong công tác quản lý, điều hành và giải quyết các TTHC, xã áp dụng hệ điều hành i-Office, phần mềm một cửa, phần mềm quản lý hộ tịch… Đồng thời xây dựng quy chế hoạt động của bộ phận một cửa, quy chế tiếp dân, phân công nhiệm vụ đối với từng cán bộ, công chức trực tiếp dân, niêm yết các TTHC, mức thu phí, lệ phí… đảm bảo việc giải quyết các TTHC nhanh gọn, chính xác và minh bạch.